注册商标被驳回后仍然需要支付费用，主要原因如下：

1. 商标申请驳回时，商标局已完成审查工作。根据《中华人民共和国商标法》的相关规定，在商标注册过程中，商标局会对商标申请进行审查，包括形式审查和实质审查。无论商标是否被驳回，商标局都已经完成了相应的工作，因此需要收取一定的费用。

2. 商标注册的费用主要用于商标注册和管理。商标注册申请费用包括了商标的注册、管理等方面的成本。无论商标是否最终注册成功，这些费用都是必须支付的。

3. 商标注册是市场行为，费用不退是国际惯例。在商标注册过程中，存在着一定的市场风险和不确定性。商标注册被驳回可能是由于多种原因造成的，例如商标缺乏显著性、与在先商标相似等。这些风险应当由申请人自行承担。

需要注意的是，虽然商标注册被驳回后费用不退，但申请人可以根据商标局的驳回理由，对商标进行相应的修改后再次申请注册，或者通过其他途径维护自己的合法权益。此外，申请人如果对商标局的决定不服，可以依法申请复审或向人民法院起诉。

总之，注册商标被驳回后仍然需要支付费用是因为商标局已完成审查工作、费用主要用于商标注册和管理、商标注册是市场行为且费用不退是国际惯例。申请人应当根据驳回理由采取相应的措施以维护自己的权益。